.此認證計劃以個別場所為發證單位。申請機構如為旗下超過一個場所申請認證，須就每個場所提交個別申請。（舉例來說，一間機構如欲為旗下十間餐廳申請認證，須提交十個申請。）
.申請機構在申請時應先確認是否為香港旅遊發展局資助的企業。若申請機構屬於受資助企業便應向香港旅遊發展局索取登記代碼；若不屬於受資助企業行列便應向香港品質保證局索取登記代碼。申請機構如未能提供有效的登記代碼將不能繼續辦理申請。
申請機構須於網站內填寫以下資訊：
- 登記代碼
- 公司名稱
- 認證場所名稱 (視乎行業類別，例如: 餐廳名稱、酒店名稱)
- 認證場所地址
- 認證場所的行業類別
- 認證場所負責人的名稱
- 認證場所負責人的職位
- 認證場所負責人的電話號碼
- 認證場所負責人的電郵地址
.填妥上述資料，申請機構須上載商業登記證副本。如申請機構屬於餐飲業，須額外提交相關飲食牌照的證明（如相片）。
.系統會根據申請機構所選擇的行業類別，提供相關的自我聲明表單。申請機構在填寫前應確保申請認證的場所有確切履行相關衛生措施，並列出具體的執行的方法，以及所使用的器材和工具。
.成功提交申請及自我聲明表單後，認證場所的負責人或審核負責人將會收到一封由系統發出的電郵，確認收妥相關申請。
.香港品質保證局在收到申請後，會於約三十天內安排不預先通知審核。審核員會於認證場所進行現場審核，以確認自我聲明表單的內容是否有效履行及滿足認證要求。
.如申請機構於現場審核中未能滿足衛生抗疫措施認證計劃手冊列明的要求，將不獲發證直至於指定時限內完成所有不符合項的整改。
.滿足要求的申請機構將於完成不預先通知審核或完成不符合項的整改後約15天內獲得認證。
.申請機構應百分之一百實施和履行在自我聲明表單中所列出的問題和陳述，以視之為符合要求。
.確認申請機構在不預先通知審核中滿足要求後，香港品質保證局會發出認證。獲證機構可得到以下交付物：
- 行業表現標準定標報告
- 數碼宣傳圖像（按要求提供）
- 電子證書
- 網上獲證機構名單
- 二維碼貼紙
.獲證機構須於認證有效期內持續滿足要求及於自我聲明表單中所陳述的聲明，並遵守相關的守則及指引。